본 연구소는 1990년 11월 21일 자연과학대학 부설 연구소로 설립되었고, 1997년 3월 1일 서울대학교 자연과학대학부속 미생물연구소로 법정화되었습니다. 본 연구소는 기초과학 분야에서 국내 최초의 미생물학 교육 및 연구기관인 자연과학대학 미생물학과와 우수연구센터인 분자미생물학연구센터를 모체로 하여 이 분야에 종사해 온 국내 유수의 연구원을 망라하여 공동연구를 수행해오고 있으며, 국제적 연구조류를 선도하는 새로운 지식의 축적을 목적으로 하고 있습니다. 본 연구소에서는 기초미생물학 및 응용미생물학 연구 외에 미생물의 수집과 분리, 보관 및 분류 등의 연구도 수행하고 있습니다.

1990년 1월 5일 서울대학교 자연과학대학 부설 연구소(비법정)로 발족하였습니다. 수학의 교육, 이론 및 그 응용에 관한 연구를 통하여 우리나라의 수학 및 다른 학문과 산업 등 국가 발전에 기여하며, 전국 공동 이용 연구소로써 전국 연구자들의 공동연구의 중심이 되어 국가적으로 보유하여야 할 수학정보센터의 구실을 하고, 국제적인 연구활동의 중심으로서 우리나라의 연구가 선진국들과 견줄 수 있도록 국제 교류의 발판으로서의 역할을 하고 있습니다.

다학제적인 기초 및 응용 연구의 수행과 더불어 다양한 융 복합 산학 과제를 추진하기 위해 2013년 6월에 설립되었으며, 세계 최고 수준의 응용학문 연구소를 목표로 학문적 인적 국제교류 협력과 다방면의 학술 활동을 추진하고 있습니다. 물리, 화학, 공학 등 다양한 전공의 참여교수들과 연구원들이 참여하고 있으며, 공동실험실인 클린룸, 저온실, 시료준비실, 바이오룸에 50여개의 공정 장비들을 갖추고 있습니다.

서울대학교 물리·천문학부의 이론물리그룹이 1980년대 초부터 국내의 이론물리 연구와 후진 양성을 주도해온 것은 자타가 인정하는 바로서, 이러한 노력의 결과로 이론물리 연구의 경우 개인별로 양적인 면에서는 거의 국제적 수준에 근접했습니다. 이 과정에서 서울대학교 이론물리교수들의 연구 활동과 각종 심포지엄 및 정기적인 세미나 개최, 외국의 유명 물리학자 초청 사업 등을 효율적으로 지원하기 위해 자연스럽게 연구소 조직의 필요성이 대두되었습니다. 그러던 차에 1989년에 정부의 기초과학 육성 방안의 일환으로 한국과학재단에서 우수연구센터(SRC) 사업을 시작함에 따라, 이를 계기로 1990년에 서울대학교 이론물리 그룹을 주축으로 이론물리학연구소(Center for Theoretical Physics; CTP)를 설립하게 되어 오늘에 이르렀습니다. 본 연구소는 지난 20여 동안 우리나라의 대표적 이론물리 전담 연구기관으로서 우리나라의 대표적 이론물리 전담 연구기관으로서 이 분야의 최첨단 연구를 수행한 것은 물론이고 다수의 신진 우수인력을 양성하는 산실로서의 역할을 다해 왔습니다.

본 연구소는 해양 연구 활성화와 우수한 후속 세대 양성을 위하여 국내외 대학이나 연구소와 다양한 협력 연구를 수행하고 있습니다.